Ну уж:) погода расчудесная, я новую голубятню начал лепить...

Это дело хорошее, видно туркам тесновато стало!
Или якобинцев решили завести?

Нет Лена, просто туркам неудобно садиться было, вот и решил с взлётно посадочной полосой голубятню сделать, благо место свободное нашлось.

Ну, что-же, давайте Леонид замахнёмся на Шекспира, то бишь разберёмся с челкарями, мраморами и другими фенотипами миндальной группы:

Домашний сизый голубь ( Columba livia ) является ярким примером разнообразия, сформированного искусственным отбором, с множеством цветов и цветовых узоров внутри и среди более чем 350 пород. Поскольку породы домашних голубей принадлежат к одному и тому же виду и являются интерфертильными, голуби предоставляют исключительную возможность понять генетическую основу признаков пигментации, используя лабораторные скрещивания и исследования геномных ассоциаций [ 3 ]. Ранее мы определили несколько генов, участвующих в определении типа и интенсивности оперения меланинов у голубей [ 4 , 5 ], но значительно меньше известно о молекулярных детерминантах осаждения рисунка [ 6]. Молекулярная основа изменчивости паттерна является захватывающей границей в генетике пигментации, и недавняя работа с другими позвоночными обнаруживает несколько генов, которые способствуют этому процессу. Тем не менее, генетическая основа пигментной структуры определенно менее понятна, чем гены, контролирующие типы пигментов [ 7 - 16 ].

Классическая картина пигментации у C. livia, известная как Almond, вызвана полудоминантной мутацией ( St аллель) в локусе Stipper ( St ), связанном с полом [ 17 ] ( Fig. 1 ). В отличие от большинства других черт пигментного рисунка у голубей, пестрое или окропленное лоскутное одеяло из цветов оперения у миндаля, по-видимому, случайно внутри и среди особей [ 18 ]. Кроме того, цветовая картина изменяется непредсказуемым образом с каждой линькой [ 19 - 21 ]. Количество пигментированных перьев у миндальных голубей также увеличивается с каждой последующей линькой, и этот эффект более выражен у мужчин [ 22 ,23 ]. Примечательно, что это явление противоположно тому, что обычно наблюдается с признаками пигментации, которые меняются на протяжении всей жизни человека, такими как витилиго и седина, что приводит к уменьшению пигмента с течением времени [ 24 - 28 ]. Помимо миндаля, по крайней мере шесть других аллелей в St приводят к различной степени депигментации у голубей, что позволяет предположить, что локус St может быть мутационной горячей точкой [ 21 , 29 ].



Фенотипы голубей, несущих миндальные аллели ( St , Almond alle; +, аллель дикого типа). (A) гетерозиготный миндальный самец. (B) Hemizygous миндальная женщина. (С) гомозиготный миндальный самец. (D) Самки миндаля не имеют видимых дефектов глаз. (E) У гомозиготных миндальных самцов часто наблюдаются серьезные дефекты зрения. Дефекты, изображенные у этого подростка, включают вздутие век и переднюю непрозрачность. (F) Крылатые перья из разных фенотипов, слева направо: не миндаль, темный миндаль, светлый миндаль, гомозиготный миндаль.

Гетерозиготные миндальные самцы (Z St Z + ) и гемизиготные миндальные самки (Z St W; самцы - гомогаметный пол у птиц), каждая из которых имеет одну копию аллеля St , ценятся селекционерами за их привлекательные цветовые узоры. Однако гомозиготные самцы миндаля (Z St Z St ) почти всегда испытывают недостаток пигментации в первом наборе перистых перьев и имеют тяжелые врожденные дефекты глаза [ 19 , 30 , 31 ] ( Fig. 1B, C).). Модель наследования миндаля предполагает, что дозировка мутантного аллеля, а не отсутствие аллеля дикого типа, ответственна за фенотип пигмента и глаза у гомозиготных мужчин. Глазные дефекты также связаны с признаками пигментации у других видов позвоночных, включая собак и лошадей, однако молекулярная основа этих связанных эффектов остается недостаточно изученной [ 9 , 32 - 37 ]. Следовательно, миндальные голуби могут освещать связи между пигментацией и дефектами глаза, в том числе то, контролируют ли плейотропные эффекты одного гена или связанных генов с отдельными эффектами эти коррелированные признаки.

В этом исследовании мы исследуем геномную идентичность локуса St у домашних голубей. Сравнения последовательностей всего генома у миндальных и не миндальных птиц показывают вариант числа копий (CNV) у миндальных птиц, который включает полные кодирующие последовательности двух генов и частичные кодирующие последовательности двух других. Один из полных генов, Mlana , играет ключевую роль в развитии меланосомы (органеллы, в которой образуются пигментные гранулы), что делает его сильным кандидатом на фенотип пигментации, наблюдаемый у миндальных голубей. Мы также обнаружили, что разные аллели в St коррелируют с разной степенью расширения одной и той же CNV, тем самым связывая спектр вариантов пигментации с изменениями в одном локусе.

РЕЗУЛЬТАТЫ
Связанная с полом область генома связана с миндальной пигментацией
Чтобы определить геномное местоположение связанного с полом локуса St , мы сравнили геномы 12 миндальных голубей с панелью из 109 не миндальных голубей из разных пород, используя вероятностную меру дифференцировки по частоте аллелей (pFst) [ 38]. ] (см. таблицу S1 для получения подробной информации). Это сканирование всего генома идентифицировало несколько значительно дифференцированных областей, но одна превосходила другие на несколько порядков и была расположена на каркасе Z-хромосомы (ScoHet5_227), как и предсказывалось в исследованиях классической генетики ( Fig. 2A ). Дифференцированная область ScoHet5_227 (положение 5,186,219-5,545,482; пик SNP, p= 1,1 e-16, порог значимости широкого генома (p = 5,5 e-10) содержал восемь аннотированных кодирующих белок генов, ни один из которых не имел фиксированных изменений кодирования в миндале по сравнению с не миндальными геномами (VAAST [ 39 ]). Следовательно, паттерн пигментации миндаля, вероятно, не является результатом несинонимичных изменений в генах, кодирующих белок.

Фигура 2.
Скачать рисунокОткрыть в новой вкладке
Фигура 2.
Миндаль связан с CNV на связанном с полом геномном каркасе. (A) Сравнение pFst всего генома между миндальными и не миндальными голубями. Каждая точка представляет позицию SNP, с оттенками серого, указывающими различные каркасы генома. Горизонтальная пунктирная серая линия обозначает порог значимости для всего генома. (B) Деталь pFst-графика для региона-кандидата на ScoHet5_227, эшафот, связанный с полом [ 104]. Генные модели изображены внизу сюжета. © Детальный вид региона CNV. Сплошная красная линия представляет среднюю нормированную глубину считывания для 10 самок миндальных птиц в этом регионе. Синяя линия является единственным представителем не миндального женского покрытия. Вертикальные пунктирные линии показывают положения точек останова CNV. Генные модели изображены ниже графика покрытия серым цветом (толстые линии, экзоны; тонкие линии, интроны).

Несколько других каркасов содержали последовательности, которые были значительно дифференцированы между миндальными и не миндальными голубями ( Fig. 2A ). Все эти области являются аутосомными, и мы предполагаем, что они связаны с другими цветовыми признаками, которые часто совместно выбираются с миндалем, чтобы дать наиболее желательную окропленную пэчворк из цветов, включая T-check (очень меланистический рисунок крыла), кайт-бронза (глубокое покраснение перьев) и рецессивный красный (феомеланическая окраска) [ 18 , 21 , 29 ]. Однако, поскольку миндаль - это признак, связанный с полом [ 17 ], мы сосредоточили наше внимание на Z-сцепленной леске ScoHet5_227.

Вариант номера копии связан с рисунком миндального пигмента
В отсутствие фиксированных изменений кодирования между миндальными и не миндальными птицами, мы затем спросили, имели ли птицы с различными фенотипами геномные структурные различия в регионе-кандидате. Мы изучили охват секвенированием на ScoHet5_227 и обнаружили, что все 12 миндальных геномов имели значительно более высокий охват в миндальной области-кандидате по сравнению с не миндальными геномами, что указывает на наличие варианта числа копий (CNV) ( Fig. 2B, C ). CNV захватывает сегмент 77-kb эталонного генома (ScoHet5_227: 5,181,467-5,259,256), с дополнительным увеличением охвата во вложенном сегменте 25-kb (ScoHet5_227: 5,201,091-5,226,635). Анализ глубины чтения подтвердил 7 копий внешнего сегмента размером 77 кб и 14 копий внутреннего сегмента размером 25 кб в геномах женщины (Z StW) Миндальные голуби, у которых St локус только на одной хромосоме. Мы использовали ПЦР для амплификации через внешние и внутренние контрольные точки CNV миндальных голубей и определили, что CNV состоит из тандемных повторов сегментов по 77 кб и вложенных сегментов по 25 кб ( рис. 3B ).

Рисунок 3
Скачать рисунокОткрыть в новой вкладке
Рисунок 3
Ассоциированная с миндалем CNV имеет сложную структуру, которая приводит к дублированию, усечению и слиянию генов. (A) Диаграмма покрытия, показывающая различные области CNV, нормализованные к области не-CNV на одном и том же каркасе. Две внешние области (1 и 3, выше график) имеют примерно 7-кратное увеличение покрытия, в то время как одна внутренняя область (2) имеет примерно 14-кратное увеличение покрытия. Генные модели изображены ниже графика покрытия серым, оранжевым и синим цветом (толстые линии, экзоны; тонкие линии, интроны). (B) Схема не миндальных (вверху) и предполагаемых миндальных (внизу) структур CNV. Структурные изменения гена в результате миндального CNV включают слияние Ermp1 и Kiaa2026 на стыке сегмента 3/1 (шестиугольник) и усеченную версию Slc16a7.на отрезке 2/2 перекрестка (звезда). Полная копия Slc16a7 встречается на каждом соединении 2/3 (ромб).

Затем мы генотипировали область CNV в более крупной выборке миндальных голубей и обнаружили значительную связь между числом тандемных повторов и фенотипом миндаля (анализ TaqMan; парный критерий Уилкоксона, p = 2,0 e-16). Почти все миндальные птицы имеют более одной копии CNV на Z-хромосому (n = 78 из 80) ( рис. 4 ). И наоборот, почти все не миндальные птицы имели только одну копию на Z-хромосому (n = 55 из 57). Две не миндальные птицы с> 1 копией на хромосому имели максимум одну дополнительную копию CNV, что указывает на то, что небольшое увеличение числа копий не обязательно вызывает фенотип миндаля. В целом, эти анализы показывают, что экспансия CNV на ScoHet5_227 связана с фенотипом миндаля.



Связанные с St фенотипы пигментации показывают количественные изменения в миндальной CNV. Черные точки представляют результаты анализа количества копий TaqMan. Средние числа копий для каждого фенотипа показаны красными точками. У большинства индивидуумов без St- связанных фенотипов ожидаемая 1 или 2 копии имеют (поскольку St - это локус, связанный с полом, у женщин минимум 1 копия, а у мужчин минимум 2). Весь другой Санкт - -связанные фенотипы связаны с расширением CNV в области кандидата на миндального строительных лесов ScoHet5_227, что указует на аллельное серии в St . Числа над каждым фенотипом указывают количество особей, отобранных.

Гены внутри CNV неправильно экспрессируются в почках миндального пера
Затем мы спросили, связана ли CNV с изменениями экспрессии генов между развивающимися миндальными и не миндальными перьями. Чтобы ответить на этот вопрос, мы сравнили экспрессию генов в области CNV среди птиц с (Z St Z + , Z St W, Z St Z St ) и без (Z + Z + и Z + W) миндальных аллелей. Мы проанализировали почки миндального пера с темной и светлой пигментацией отдельно, чтобы оценить, различалась ли экспрессия между качественно различными типами пигментации пера, оба из которых присутствуют в Z St Z + и Z StW миндальные особи. CNV содержит полные кодирующие последовательности двух генов, Mlana и Slc16a7 , и частичные кодирующие последовательности двух дополнительных генов, Ermp1 и Kiaa2026 ( Fig. 3A ). Предполагается, что Mlana будет иметь до 14 полных копий на Z St хромосому на основе последовательности секвенирования у Z St W миндальных птиц ( Fig. 3B ). Млана экспрессируется почти исключительно в меланоцитах (меланин-продуцирующих клетках) и кодирует белок, который важен для созревания меланосом благодаря взаимодействию с матриксообразующим белком Pmel [ 40 - 42]. Таким образом, сочетание биологической роли Mlana и его расположения в миндальной CNV делает Mlana сильным кандидатом гена для фенотипа миндаля.

По сравнению с не миндальными перьями, экспрессия Mlana повышается в темных перьях , но не в светлых перьях, от Z St Z + и Z St W миндальных птиц или непигментированных перьевых бутонов гомозиготных миндальных (Z St Z St ) птиц. ( Рис. 5A ; см. Таблицу S2 и Таблицу S3 для необработанных данных для всех экспериментов qRT-PCR). Мы заметили, что дисперсия экспрессии наблюдается для Мланакак в темных, так и в светлых почках миндального пера, хотя и не являющихся статистически значимыми (тест Колмогорова-Смирнова), тренды выше, чем в образцах, не относящихся к миндалю. Это распределение данных может отражать изменчивость самого фенотипа, который характеризуется различными количествами и интенсивностью пигментации пера как внутри, так и между Z St Z + и Z St W миндальными голубями.

Рисунок 5
Скачать рисунокОткрыть в новой вкладке
Рисунок 5
Почки почек миндаля и миндаля имеют четкие профили экспрессии генов. (A) Экзоны, проанализированные в CNV, показывают различия экспрессии в почках миндального пера по сравнению с не миндалем. Боксовые диаграммы показывают результаты анализов qRT-PCR, разработанных для оценки экспрессии генов экзонов, расположенных в области CNV. Результаты экспрессии слитого гена получены из праймеров КПЦР, охватывающих экзон 7 Ermp1 в экзон 5 Kiaa2026.(B) Экзоны, проанализированные вне CNV, не показывают различий экспрессии в почках миндального пера по сравнению с не миндальным. Это указывает на различия в экспрессии, характерные для экзонов внутри CNV. © Экспрессия генов, связанных с меланоцитами. Результаты рт-ПЦР указывают на снижение экспрессии нескольких генов, участвующих в выработке меланина в почках миндального пера. (D) Модель взаимодействия между генами и сигнальными путями, вовлеченными в различные аспекты синтеза пигмента. Серые прямоугольники указывают пути, обсуждаемые в тексте, но не представленные непосредственно в нашем анализе выражений. NA, почечные перья у не миндальных особей с аллелями дикого типа на St; DA - почки темного миндального пера у особей гемизиготных и гетерозиготных миндалин; LA - легкие почки миндального пера у гемизиготных и гетерозиготных особей миндаля; HA, перо почки от гомозиготного миндального человека. Столбец в каждом квадрате представляет медиану, концы бокса обозначают верхний и нижний квартили, усы - самое высокое и самое низкое значение, исключая выбросы. Разные буквы обозначают группы со статистически значимыми различиями в экспрессии генов, определяемыми с помощью ANOVA и специального теста Тьюки (р <0,05).

Другие гены, полностью или частично в пределах CNV, демонстрируют повышенную экспрессию в перьях птиц с по меньшей мере одним миндальным аллелем по сравнению с не миндальными птицами. Slc16a7 кодирует монокарбоксилатный транспортер и, по прогнозам, будет амплифицирован до шести полноразмерных копий у миндальных голубей ( Fig. 3B ). Мы наблюдали 40-кратное увеличение экспрессии Slc16a7 в почках миндального пера по сравнению с не миндалем ( Fig. 5A ). Slc16a7, как известно, не важен в пигментации; однако этот ген экспрессируется у млекопитающих, где он участвует в транспорте молочной кислоты и осмотическом балансе [ 43 - 47 ].

В дополнение к двум генам, полностью содержащимся в CNV, предсказано , что новое слияние Ermp1 (ген металлопептидазы) и Kiaa2026 (неизвестная функция) охватит внешние контрольные точки CNV ( Fig. 3C ). Ни один из генов не играет роли в пигментации или развитии глаз. Предсказанный слитый белок Ermp1 / Kiaa2026 представляет собой усеченную версию Ermp1, включая пептидазный домен и 3 из 6 трансмембранных доменов ( Fig. 3B ). 22 аминокислоты из Kiaa2026 на С-конце слитого белка не включают в себя известный домен белка [ 48 ]; таким образом, слитый белок вряд ли создаст новую комбинацию функциональных доменов. Как и ожидалось, Ermp1 / Kiaa2026ген слияния не экспрессируется в перьях не миндальных птиц, но экспрессируется в птицах с миндальными аллелями ( Fig. 5A ). Когда мы проанализировали экспрессию экзонов Kiaa2026 и Ermp1, расположенных вне CNV, мы не наблюдали различий в экспрессии между генотипами ( Fig. 5B ). Таким образом, миндальный CNV связан с экспрессией нового слитого гена, но не с различиями в экспрессии полноразмерных транскриптов обоих участвующих генов. Аналогично, Ric1 , ген, находящийся непосредственно за пределами CNV, демонстрирует умеренное (менее чем в два раза) увеличение экспрессии в светлых миндальных перьях по сравнению с другими типами перьев ( Fig. 5B).). Таким образом, гены внутри CNV демонстрируют вариабельную или повышенную экспрессию в перьях миндальных птиц, тогда как гены, прилегающие к CNV, демонстрируют незначительное или нулевое изменение экспрессии.

Изменения экспрессии генов свидетельствуют о дисфункции меланоцитов в почках миндального пера
Паттерны пигментации оперения у Z St Z + , Z St W и Z St Z St Миндальные птицы радикально отличаются от не миндальных птиц, что позволило нам предположить, что другие компоненты пути меланогенеза также могут отличаться. Продукция меланина меланоцитами является многостадийным процессом, который начинается с активации нескольких путей, включая передачу сигналов Wnt и Mc1r, посредством внеклеточных лигандов и агонистов [ 49 - 52 ]. Впоследствии экспрессия транскрипционных факторов, включая Mitf, активирует генетический каскад, который в конечном итоге способствует созреванию функционального меланоцита [ 53]. Внутри самого меланоцита ряд ферментативных реакций и сборка меланосомы приводят к образованию и отложению пигментов. Меланосомы затем переносятся в клетки кожи и эпидермальные придатки, включая перья. У голубей и других птиц с пигментами на основе меланина баланс отложений феомеланина (красные, желтые) и эумеланина (черные, коричневые) определяет цвет оперения [ 54 ].

Чтобы определить, расходуются ли сигналы продукции пигмента между почками миндального и не миндального пера, мы измерили экспрессию нескольких маркерных генов для созревания и функционирования меланоцитов с помощью qRT-PCR. Сначала мы изучили гены, участвующие в выживании и дифференцировке меланоцитов, которые являются критическими ранними событиями в производстве меланина. Sox10 , который кодирует транскрипционный фактор, который активирует экспрессию многих нижестоящих генов, включая экспрессию Mitf , Tyrosinase и Tyrp1 [ 55 ], подавляется только в легких почках миндального и гомозиготного миндального пера ( Fig. 5B ). Потому что Sox10 регулирует Mitfи другие гены меланоцитов, этот результат указывает на то, что дисфункция меланоцитов возникает рано у слегка пигментированных миндальных перьев, но не у темных миндальных перьев. Второй маркерный ген дифференцировки и выживания меланоцитов, Mitf , кодирует транскрипционный фактор, который активирует экспрессию тирозиназы, Tyrp1, Pmel и Mlana [ 40 , 53 , 56 , 57 ]. В отличие от Sox10 , Mitf не дифференциально экспрессируется ни в одном из протестированных нами фенотипов ( Fig. 5C ). Этот результат предполагает, что меланоциты присутствуют в перьях всех фенотипов, даже в сильно депигментированных перьях [ 9].]. Два гена, которые активируют экспрессию Mitf ( Sox10 и Mc1r , см. Ниже; Fig. 5C ), подавлены, что означает, что Mitf также будет подавлен. Однако сохранение высокой экспрессии Mitf может быть результатом активации другими путями, такими как передача сигналов Wnt и c-Kit [ 56 ]. Вместе наши результаты экспрессии генов показывают, что меланоциты присутствуют во всех почках пера миндальных голубей ( экспрессия Mitf ), но снижается Sox10Экспрессия в светлых и гомозиготных миндальных перьях предполагает, что множественные копии миндальной CNV связаны с дисфункцией в начале меланогенеза у светлых и гомозиготных миндальных перьев ( экспрессия Sox10 снижена).

Затем мы проанализировали гены, участвующие в производстве пигмента, показатель функции меланоцитов. Mc1r , который кодирует связанный с G-белком рецептор, необходимый для выработки эумеланина [ 58 ], и тирозиназа , которая кодирует критический фермент для выработки как эумеланина, так и феомеланина, подавлялись только в гомозиготных почках миндального пера ( Fig. 5C ). Следовательно, на экспрессию двух ключевых детерминант продукции пигмента влияют только самые тяжелые фенотипы депигментации. Tyrp1 , который кодирует другой фермент, важный для эумеланина, но не для производства феномеланина [ 59], был подавлен во всех почках миндального пера, с наиболее серьезными эффектами в легких и гомозиготных почках миндального пера ( Fig. 5C ). Таким образом, путь синтеза эумеланина затрагивается во всех миндальных перьях, но на светлые миндальные и гомозиготные почки миндального пера больше влияют гены генерации пигмента и функции меланоцитов, при этом наиболее сильное подавление наблюдается у гомозигот ( рис. 5C ).

Наконец, мы измерили экспрессию гена меланосомной структуры Pmel . Считается, что структура меланосомы необходима для эумеланина, но не для производства феомеланина [ 60 ]. Pmel является амилоидным белком, который образует часть меланосомного матрикса, важного структурного компонента зрелой меланосомы [ 60 - 62 ]. Наш кандидатный ген Mlana кодирует белок, который взаимодействует с Pmel и также важен для формирования матрицы меланосом. Мы обнаружили, что Pmel подавляется во всех почках миндального пера, и наиболее сильно в двух наиболее депигментированных типах: светлый миндаль и гомозиготный миндаль ( Fig. 5C ). Как описано выше, Мланаэкспрессия увеличилась у темных миндальных перьев, но была похожа на не миндальную у светлых миндальных и гомозиготных миндальных перьев. Эти результаты трудно согласовать, потому что эти два гена регулируются Mitf. Тем не менее, наши результаты показывают, что даже пигментированные перья у миндальных птиц показывают измененную экспрессию генов пигментации.

Таким образом, в гомозиготных почках миндального пера путь производства пигментации изменяется на ранней стадии эумеланогенеза. У птиц с одной копией миндального аллеля (Z St Z + и Z St W) легкие перья демонстрируют подавление большего количества генов производства эумеланина, чем темные перья. Таким образом, фенотипически разные миндальные перья имеют различные профили экспрессии пигментных генов.

Другие аллели в локусе St являются вариантами числа копий
Классические генетические исследования указывают на множественные аллели депигментации в локусе St [ 20 , 29 , 63 , 64 ]. Чтобы определить, связана ли миндальная CNV с этими другими аллелями, мы генотипировали голубей с другими связанными с St фенотипами и обнаружили значительное увеличение числа копий в Qualmond ( St Q ; N = 10, p = 8.3e-06), Sandy ( St Sa ; N = 3, p = 3,2 e-02), блеклый ( St Fa ; N = 11, p = 5,0e-07) и Chalky ( St C ; N = 6, p= 2.7e-04) голуби по сравнению с птицами без St- связанных фенотипов ( рис. 4 , таблица S4). Другой аллель, Frosty ( St fr ), показал тенденцию увеличения числа копий, которая не достигла значимости (N = 6, p = 1). Вместе эти результаты демонстрируют, что увеличение числа копий связано с множеством аллелей депигментации в локусе St.

PS: если что не понятно по тексту, обращайтесь, по возможности - объясню.

Привет сообщество.
Виктор ,Вам бы в ученики чел 15-20 молодых голубятников, тогда глядишь наша страна и сделала бы РЫВОК в работе с птицей, для меня генетика ,непроходимые дебри, хотя уверен что без неё хорошей масти не получишь

Леонид, что за рывок Вы ожидаете от людей понимающих генетику?
Эта статья (результаты исследований) просто объясняет, что челкарей, каплан и всякий там мрамор, не возможно получить скрещивая разных по масти голубей. Все эти фенотипы, результат мутантного гена находящегося на половой хромосоме в локусе Stipper.

Да это я словами одного кекса:)РЫВОК:)
А вообще где то видел голубя у которого маховые и хвост были через перо белые и красные, ну наверно это генетика?!

Леонид, это не генетика, а случайность, так как нет генов для каждого пера отдельно.

С Вами спорить, себе дороже:)Я не утверждаю но птичка была красивая.

Леонид, я не спорю.
Генетика это тогда, когда можно наплодить армию клонов.

Виктор привет.Два голубя от разных родителей но оба имели проблемы со зрением.На фото 2 птенцы с такой мастью бывают иногда с проблемами по зрению.Еще об этом говорил Вальдемар на старом форуме.На фото 1 мраморный, как я понимаю не миндальный,но с проблемами по зрению.Мать у него мраморная,отец сизый.У меня вопрос.Может ли птенец на фото 1 быть незаконнорожденным от отца птенца с фото 2? Так как открытые в общем помещении гнезда дают примерно 12-17 % незаконнорожденных птенцов. Или это просто совпадение?

1


2

Василий, откуда такая статистика, тем более, если Вы держите не большое поголовье, у меня, при не большом поголовье, я бы сказал процент нулевой.

БЛОКНОТ ГОЛУБЕВОДА:
Дж. У. Куинн
Незаконнорожденность (бастарды) у Голубей

Привет.
Василий если судить по выставленным фотографиям, то особь №1 имеет сизый базовый цвет, а особь №2 зольно-красный (т. е. он сиреневый).
При таком раскладе особь №1 не может быть сыном, особи №2.
Но тут возникает вопрос по фенотипу особи №2 во взрослом состоянии, если он на самом деле сизый, то это полностью перевернет первый вывод.
Короче, нужно фото взрослого №2.


Сейчас в младенческом пере он похож на квальмонд, но с возрастом у него фенотип может поменяться. И вообще я не сторонник разделять этих пёстроокрашенных на всяких там альмондов , квальмондов и т. д., так как их фенотип образован действием одного и того же гена.



Василий, если Вы внимательно читали статью про альмондов, то вам моя мысль будет понятна. В этой статье есть такая аббревиатура "CNV" (Copy Number Variant), т. е. "вариация числа копий". В этой статье говорится о гене в котором некая последовательность нуклеотидов повторяется несколько раз (в генетике такая мутация называется - экспансией тандемных повторов). В зависимости от числа повторов, происходит изменение фенотипа. По этим фенотипам этот мутантный ген разделили на 7 аллелей, т. е. пологая, что каждый фенотип соответствует определённому числу копий тандемных повторов. Всем этим аллелям дали свои названия (например как Вы, тоже разделяете на мраморных и на челкарей).
А теперь внимательно посмотрите на график. Левая вертикальная шкала это число тандемных повторов, красная точка - среднее число копий, цифрами обозначено количество исследуемых особей. По горизонтали названия фенотипов и их фото.
Самое интересное это то, что число соответствующее 7 копиям соответствует 6 фенотипам, т. е. разделение всех этих пёстроокрашенных в том числе челкарей и мраморных по разным названиям (наименованиям) - условное.

Василий, вообще считают, что проблемы со зрением бывают только у гомозиготных альмондов, но я полагаю (и на счёт этого мы обсуждали с Алтайским с соседнего форума), что вполне возможно и гетерозиготные имеют проблемы, если в фенотипе присутствует разбавление.
И это вполне закономерно, зрение основано на пигменте (чёрном), так как именно чёрный пигмент поглощает все волны видимого спектра, раз есть проблемы с цветообразованием, т. е. ген ответственный за осаждение пигмента не функциональный, то естественно и зрение имеет патологию.

И все же, чем челкарь отличается от мраморного в фенотипе ? если не лезть в генетику..Мне когда то давно, не один десяток лет назад поясняли, что у челкаря не должно быть ни одного белого пера и пятна, только тогда он челкарь и как можно больше разного цвета9синий,зеленый. черный. красный и тд) а если присутствует белое перо или пятно.это уже мрамор. но не как не челкар,от кого бы он не вывелся...как с научной точки зрения ? да и не с научной тоже ?

Владимирович, генетически что челкарь, что мраморный совершенно одинаковые, т. е. братья. Всё зависит от того что данная особь будет иметь в генотипе по другим цветообразующим факторам. Например если это сизый то в облике челкаря он не будет иметь красное перо, если это сиреневый, то он не будет иметь сизое перо, т. е. всё зависит от наличия других цветообразующих факторов в генотипе.
Владимирович, вот в Африке проживают негры с телом разной интенсивности окраса, есть очень чёрные, есть пепельно-чёрные, есть сине-чёрные, есть шоколадные, но все они негры, других названий расы нет.
Я конечно не призываю изменить названия мастей, но вот эта генетическая характеристика рябоокрашенности, она не предсказуема, может так получиться, жил жил челкарь, не тужил, а с очередной линькой, раз и вылезло белое перо, был челкарь и вдруг стал мрамор.

Виктор , привет !!! Согласен с вами,тем более название масти да и сама масть для меня как то дело третье. я за этим не убиваюсь...но и врать то не буду, как и всем хотелось бы чтоб птица была красивая..Но в угоду масти или названию, я ни когда не стану приносить в "жертву" лет и игру...особенно игру...Ну это опять же мое личное мнение для своей птицы...А интересуюсь в качестве приобретения знаний.лишние то они ни когда не будут,обычно не хватает..

Привет генетики.
Тогда все голубятники генетики, они же всю жизнь тем и занимаются что плодят клонов:)
Мне пару лет тому , понравились шоколадные мраморы, вот я набрал себе по соседям мраморных разношёрстных и начал из гтх лепить щоколадных,....пока не получаются, но сдвиги уже есть и без всяких знаний генетики

Плодить однотипный мрамор это утопия, примерно похожими будут, но в деталях никогда (или почти никогда).

Никто и не говорит об однотипных, мрамор чем и хорош, что не знаешь чего они выкинут, а если ещё и предки неизвестны, тады ваще труба:)

Во, во.
Леонид, если это сизобазовые, то без бронзы не обойтись, а если зольно-красные, то без чёрных не обойдёшься.
Имеется ввиду для получения шоколадных.

Уже начали давать , даже и не знаю как цвет назвать, короче ещё не шоколад, а красно буро с примесью ещё чего то:) и чёрный,...так что там видимо всё есть,

Не забудьте потом фото выставить, интересно будет взглянуть.

обязательно!

Виктор а что вы имеете ввиду под названием шоколадные?

В деталях даже шейки разные!

Конфеты БЕЛОЧКА, Петрович, когда тебя отпустили?:)

А вы Виктор???

Валера, а что Ты у меня об этом спрашиваешь?

Я хочу понять, что вы понимаете по шоколадом, какую масть?

Виктор привет.Хочу сказать вам большое спасибо. Всю информацию которую вы даете считаю для себя бесценной.Я сам бы ее никогда не нашел.

Лично я не знаю.

Василий, да бросьте Вы всё преувеличивать, интернет большой, главное что бы интерес был копаться.
Василий, так фото №2 взрослого будет?

Виктор привет.Фото 2 взрослого не будет.Он ушел в выбраковку.

Привет генетики, Валерка и тебе привет, хоть ты и не генетик!
Виктор, как Вы дуиаете, из чего турки получили таких красавцев как "АЧИК ЧАКМАКЛИ" , ведь чакмакли просто дикари ничего не имеющие с ачик , или турки попутали что то с названиями?

Белую масть в ачик наверно не вливали?!

Виктор,у меня закрадываются смутные сомнения по поводу выведения цветных такла, уж не генная ли там инджинирИя?:)

Леонид, а можно фото, а то получается беспредметный разговор.


Да полно вам, какая инженерия, обычный бессознательный отбор.

[quote name='Виктор Чебоксары' date='23.2.2020, 15:55' post='165968']
Леонид, а можно фото, а то получается беспредметный разговор
Завт ра попробую что нибудь сварганить

Биологи проанализировали геномы домашних голубей ( Columba livia ), чтобы определить мутации, которые определяют четыре основных цветовых узора на перьях крыльев голубей. Они сравнили стандартный «родовой» рисунок по умолчанию, названный в честь горизонтальных черных полос возле кончиков крыла, с немного более темным рисунком «шашки», самым темным рисунком «Т-чек» и самым легким рисунком «без баров» (беспоясов).



У многих одомашненных голубей мы наблюдаем на крыльях, четыре рисунка окраски с разным количеством пигментации: самый темный рисунок «T-check» (вверху слева), чуть менее темный рисунок «checker» (вверху справа), наследственный рисунок «bar» ( внизу слева) и самый легкий «безбарочный» (беспоясый) рисунок (внизу справа).



Они обнаружили, что последовательность ДНК рядом с геном NDP сильно отличалась между птицами-барами и птицами T-check и checker. Кроме того, некоторые голуби T-check и checker имеют больше копий участка ДНК рядом с геном , что приводит к еще большему количеству пигмента в их перьях. Во всех случаях сама последовательность гена остается неизменной. Напротив, у наименее пигментированных беспоясых птиц была мутация в самой последовательности гена, которая могла повлиять на ее функцию.

«Это довольно странно. Это один и тот же ген, но он модифицирован по-разному, чтобы получить совершенно разные результаты », - сказал Майкл Шапиро, профессор биологии в U и старший автор статьи.

Это первый раз, когда NDP ассоциируется с изменением пигмента. Заводчики голубей сообщают, что беспоясые птицы имеют проблемы со зрением. Это исследование обнаружило, что та же самая мутация NDP, обнаруженная у голубей без поясов, также обнаружена в двух человеческих семьях с наследственной слепотой, предполагается, что эта часть гена NDP важна для развития глаз.

Леонид, вливание белых, даст белопятнистых, а чтобы осветлить "чакмакли" наверное вливали особей с генетическим фактором "milky" или "Ice", например таких:



В итоге получились "ачик чакмакли":



Надеюсь я правильно ответил на ваш вопрос.

Я тоже надеюсь, запарил то я их (белую и чакмакли) конкретно по рабочим качествам и плюс они оба маленькие т е подходят под описание анкара, ну а что получится посмотрим...

Так я вам и так скажу что получится, получатся с белой головой, с белыми перьями в хвосте и маховых. По цвету сыновей, ничего не могу сказать, так как не известно какой цвет несёт белая голубка, а дочки будут сизорябые как я описал в первом предложении.

Виктор, самец чакмакли,когда родился у него было одно белое перо в крыле главное маховое, я потому их и запарил, что в нём уже плавает белая масть, ну вобщем время покажет

Леонид, да никакой белой масти в нём не плавает, кроме белоконцовости.

А она откуда могла взяться у дикариной масти?

И почему это перо вылиняло?

Раз вылиняло, так и переживать нечего.

Леонид, пигмент вырабатывается меланоцитами (клетки такие пигментные). Эти пигментные клетки образуются (происходят) из нервного гребня в эмбриональном периоде развития организма в виде меланобластов, которые мигрируют в эпидермис, где трансформируются в меланоциты. У домашних животных иногда миграция этих клеток нарушается или задерживается.
https://dic.academic.ru/dic.nsf/ruwiki/1560790